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好氧菌种能去除BOD、COD及TSS，显著提高沉淀池内固体沉降能力，增加原生动物的数量和多样性。 3、启动与恢复系统，提高系统处理能力及抗冲击能力，有效减少剩余淤泥产生量，减少絮凝剂等化学药品的使用，节省电力。
好氧和厌氧工艺的优缺点
与厌氧处理工艺相比，好氧处理具有一些明显的优势。这些包括减少气味（由于不产生硫化氢或甲烷）和更好的营养物去除功效（促进直接排放到地表水或消毒）。然而，好氧处理确实有几个缺点。氧化是一种能源密集型过程，严重增加了该过程的整体能源消耗、效用和维护成本。微生物无法消化的固体废物通常会以生物固体的形式沉淀下来。这些生物固体需要适当的处理，增加了公用事业和维护成本。

干泥接种培菌法
有条件的话可以选取已经正常运行的污水系统中的污水脱水后的干污泥作为菌种源进行接种培养。一般按曝气池总容积的1%的干泥量。加适量水捣碎，在加适量的工业废水和粪便水。如此便能很快形成浓度较高的活性污泥。
好氧条件下摄磷
好氧条件下，聚磷菌的活力得到恢复，并以聚磷的形式存储超过生长所需的磷量，通过PHB的氧化代谢产生能量，用于磷的吸收和聚磷的合成，能量以聚磷酸高能键的形式捕集存储，磷酸盐从水中被去除。
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在活性污泥的培养中，DO的供给量要根据活性污泥的结构状况、浓度及废水的浓度综合考虑。具体说来，也就是通过观察显微镜下活性污泥的结构即成熟程度，测量曝气池混合液的浓度、监测曝气池上清液中CODCr的变化来确定。根据经验，在培养初期DO控制在1～2mg/l，这是因为菌胶团此时尚未形成絮状结构，氧供应过多，使微生物代谢活动增强，营养供应不上而使污泥自身产生氧化，促使污泥老化。在污泥培养成熟期，要将DO提高到3～4mg/l左右，这样可使污泥絮体内部微生物也能得到充足的DO，具有良好的沉降性能。在整个培养过程中要根据污泥培养情况逐步提高DO。
由于生物除磷系统主要通过排出剩余污泥实现除磷，因此剩余污泥量的多少决定系统的除磷效果，而泥龄长短对剩余污泥的排放量和污泥对磷的摄取作用有直接的影响。污泥龄越小，除磷效果越佳。这是因为降低污泥龄，可增加剩余污泥的排放量及系统中的除磷量，从而削减二沉池出水中磷的含量。但对于同时除磷脱氮的生物处理工艺而言，为了满足硝化和反硝化细菌的生长要求，污泥龄往往控制得较大，这是除磷效果难以令人满意的原因。一般以除磷为目的的生物处理系统的泥龄控制在3.5~7d。